ปีการศึกษาที่สามของแฮร์รี่เริ่มต้นท่ามกลางข่าวร้าย — ซิเรียส แบล็ก นักโทษผู้หลบหนีจากคุกอัซคาบัน ซึ่งเชื่อกันว่าเป็นผู้ติดตามของลอร์ดโวลเดอมอร์ ได้หลุดออกมาอย่างลึกลับ และเป้าหมายของเขาคือแฮร์รี่ พอตเตอร์
แม้จะถูกคุกคามจากผู้คุมวิญญาณ สิ่งมีชีวิตที่ดูดความสุขและความทรงจำดีๆ ไปจากผู้คน แฮร์รี่ยังคงเดินหน้าเรียนรู้เวทมนตร์ต่อไป โดยมีศาสตราจารย์ลูปิน อาจารย์วิชาการป้องกันตัวจากศาสตร์มืดคนใหม่ ที่ช่วยสอนคาถาผู้พิทักษ์ให้เขา เพื่อป้องกันตัวเองจากอันตรายที่ใกล้เข้ามา
ความจริงที่ซ่อนอยู่เกี่ยวกับการทรยศในอดีตและตัวตนของซิเรียสถูกเปิดเผยอย่างพลิกผัน เมื่อแฮร์รี่ค้นพบความเกี่ยวข้องระหว่างพ่อของเขากับชายผู้ถูกกล่าวหาว่าเป็นศัตรู ความสัมพันธ์ที่ไม่คาดคิดทำให้แฮร์รี่ต้องตัดสินใจครั้งสำคัญระหว่างความแค้นกับความยุติธรรม